Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms