Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smurf1Q9CUN6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf1Q9CUN6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms