Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mri1Q9CQT1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mri1Q9CQT1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms