Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudcd2Q9CQ48 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms