Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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