Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms