Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms