Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms