Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms