Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf2Q99LE6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms