Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg5Q99J83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms