Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn16Q925N4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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