Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEC4

Calhm2, Calcium homeostasis modulator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm2Q8VEC4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calhm2Q8VEC4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calhm2Q8VEC4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms