Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlrp3Q8R4B8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp3Q8R4B8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms