Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colec12Q8K4Q8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms