Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfn5Q8CBA2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms