Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssuh2Q8C3L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms