Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa21Q8C1P2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms