Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
6820408C15RikQ8BJX2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
6820408C15RikQ8BJX2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms