Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIA3

Mkx, Homeobox protein Mohawk, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkxQ8BIA3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MkxQ8BIA3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms