Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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