Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul9Q80TT8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul9Q80TT8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms