Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf8Q80TJ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf8Q80TJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms