Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec18aQ7TSQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms