Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnfsf18Q7TS55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms