Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphp3Q7TNH6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms