Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stambpl1Q76N33 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stambpl1Q76N33 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms