Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasa4Q6PFQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms