Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cntn4Q69Z26 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn4Q69Z26 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms