Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ino80dQ66JY2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ino80dQ66JY2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ino80dQ66JY2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ino80dQ66JY2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms