Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VclQ64727 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VclQ64727 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VclQ64727 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VclQ64727 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms