Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CcncQ62447 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CcncQ62447 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CcncQ62447 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms