Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SypQ62277 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SypQ62277 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SypQ62277 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SypQ62277 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms