Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms