Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtafrQ62035 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms