Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcbp2Q61990 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcbp2Q61990 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms