Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms