Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epha1Q60750 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms