Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NotoQ5TIS6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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