Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms