Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms