Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms