Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms