Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5EBG8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Q5EBG8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5EBG8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms