Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms