Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtl5Q5DTT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms