Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl6Q505G4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms