Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms