Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa20Q45VN2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Defa20Q45VN2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Defa20Q45VN2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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