Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms